Memo

• GPhysの軸を変更する
• gtool5を用いたNetCDFファイルのGlobal Attributeの設定
• RubyでNetCDFファイルのGlobal Attributeの値を取得する
• Carbon Emacs, Cococa Emacs パッケージ内のlisp置き場
• Mac OSX 上でifortで数値計算するときの注意
• Mac のファイルシステムは大文字/小文字を区別しないので.f ファイルと.Fファイルが区別されず, プリプロセッサが使われない.
• MacPortsでインストールしたTeX環境に独自のスタイルファイルを追加する

GPhysの軸を変更する

一例：緯度をサイン緯度に変換

include NumRu; include Math; include NMath

gphys01.axis(0).set_pos(VArray.new(sin(gphys01.axis(0).pos.val*PI/180.0), nil, "sin_lat") )
 

• gphys01: GPhysオブジェクト
• .axis(0): 0番目の軸
• .set_pos(新しい軸のVArrayオブジェクト): 軸の格子点を定義する
• VArray.new(NArrayオブジェクト, nil, "軸の名前"): VArray オブジェクトの生成、第二引数はAttributesで
• sin(gphys01.axis(0).pos.val*PI/180.0): 元々の緯度軸(Deg)を取り出して、Radに変換して、sinをとる

参考：Reference manuals of the GPhys library

gtool5を用いたNetCDFファイルのGlobal Attributeの設定

一例：

   call HistoryAddAttr('u','+External_Thermal_Rossby_Number',thermal_Rossby)
 

• 第1引数はnetcdf内に書き込む変数名"varname"。何でもよい。
• 第2引数がGlobal Attributeの名前。先頭に"+"を付けること。でないと第1引数の変数のAttributeになる。
• 第3引数に値が格納されている変数を与える。

参考：属性(attribute)をつける

RubyでNetCDFファイルのGlobal Attributeの値を取得する

一例：

   nc = NetCDF.open("hoge.nc") 
  RT =  nc.att("External_Thermal_Rossby_Number").get
 

• 第1文でNetCDFファイルのオープン。
• 第2文でGlobal Attributeの "External_Thermal_Rossby_Number"の値を取得してRTに格納する。

参考：Rubyist Magazine - Ruby Library Report 【第 5 回】 数値計算と可視化

Carbon Emacs, Cococa Emacs パッケージ内のlisp置き場

Emacs.app/Contents/Resources/site-lisp/以下

Mac OSX 上でifortで数値計算するときの注意

• -openmp を付けるとすべての変数がスタックされる.
• Mac OSXのスタックサイズはデフォルトで8MB.
• ulimit -s で大きく増やせない.
• 大きなスタックが要るとき(例えば256MB)は以下のようにコンパイルオプションを付ける
  -Wl,-stack_size,0x10000000
• 0xは16進数であることを示し, 100000....が欲しいスタックサイズ.
• 参考:Intel® Fortran Compiler - Increased stack usage of 8.0 or higher compilers causes segmentation fault - Intel® Software Network
• 参考PDF

Mac のファイルシステムは大文字/小文字を区別しないので.f ファイルと.Fファイルが区別されず, プリプロセッサが使われない.

MacPortsでインストールしたTeX環境に独自のスタイルファイルを追加する

環境に追加したいスタイルファイル （.styファイルや.clsファイル）を以下のディレクトリに移動 or コピーします。
/opt/local/share/texmf-local/tex/latex
コピーが完了して終わりではありません。
以下のコマンドを入力し、スタイルファイルを有効にする必要があります。
$ sudo mktexlsr
以下の用に実行結果が表示されれば、スタイルファイルの導入は成功です。

    mktexlsr: Updating /opt/local/share/texmf/ls-R... 
    mktexlsr: Updating /opt/local/share/texmf-config/ls-R... 
    mktexlsr: Updating /opt/local/share/texmf-dist/ls-R... 
    mktexlsr: Updating /opt/local/share/texmf-local/ls-R... 
    mktexlsr: Updating /opt/local/share/texmf-var/ls-R... 
    mktexlsr: Updating /var/tmp/texfonts/ls-R... 
    mktexlsr: Done.